Quake II to sequel jednego z najpopularniejszych FPSów świata. Fabuła gry kontynuuje wątki z części pierwszej. Po uzyskaniu przewagi w walce ze Stroggami, ludzie zdecydowali się przenieść front na świat swoich przeciwników. Wcielamy się w jednego z wysłanych żołnierzy, który po lądowaniu odkrywa, iż większość współtowarzyszy zginęła i on jako jeden z nielicznych musi stawić czoła kosmitom. Bierzemy więc broń w dłoń i ruszamy na wielką eksterminację.